Dalam program akademik ilmu alam, banyak cabang lapangan mungkin dieksplorasi secara mendalam dengan tujuan mengamati dan belajar tentang alam. Beberapa cabang ini dapat mencakup astronomi, biologi, fisika, ekologi dan kimia.

Ada beberapa lembaga untuk pendidikan tinggi di seluruh Puerto Rico, dengan The University of Puerto Rico menjadi yang tertua dan terbesar. Sebagai wilayah Amerika Serikat, warga dapat memiliki akses ke kesempatan tambahan untuk pendidikan.